Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPTAN1Q13813 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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