Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1SQ13698 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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