Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SF3B2Q13435 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SF3B2Q13435 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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