Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN3Q13286 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms