Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GRIN2BQ13224 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GRIN2BQ13224 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2BQ13224 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
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