Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK3Q13003 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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