Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COX10Q12887 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COX10Q12887 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COX10Q12887 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX10Q12887 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX10Q12887 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX10Q12887 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX10Q12887 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms