Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GTF3C1Q12789 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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GTF3C1Q12789 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF3C1Q12789 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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