Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	ANR2	YKL047W	1551 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	YDR336W	YDR336W	945 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	MPC1	YGL080W	393 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	PRM6	YML047C	1059 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	FPR1	YNL135C	345 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	YOL159C-A	YOL159C-A	273 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SRL1	YOR247W	633 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	ACM1	YPL267W	630 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SCD5	YOR329C	2619 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SST2	YLR452C	2097 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SAP190	YKR028W	3102 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	RPS24A	YER074W	408 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	KEG1	YFR042W	603 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	SFT1	YKL006C-A	294 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	RPS29A	YLR388W	171 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TY3A-G	Q12173	IPI3	YNL182C	1668 nt		2.59	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.58	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.58	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.58	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.58	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	MST27	YGL051W	705 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	RPL24B	YGR148C	468 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	RUF20	RUF20	443 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	GDI1	YER136W	1356 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	CDC5	YMR001C	2118 nt		2.57	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	COB	Q0105	1158 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SRL3	YKR091W	741 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	EAF7	YNL136W	1278 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	DUG3	YNL191W	1074 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	PDR17	YNL264C	1053 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	COQ10	YOL008W	624 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SEC16	YPL085W	6588 nt		2.56	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YCR064C	YCR064C	411 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	TIM11	YDR322C-A	291 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	PEX4	YGR133W	552 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YLR108C	YLR108C	1458 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	ADI1	YMR009W	540 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	MPP6	YNR024W	561 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	TSR4	YOL022C	1227 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YOL166C	YOL166C	339 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	PIS1	YPR113W	663 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.55	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YCR016W	YCR016W	873 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	UPF3	YGR072W	1164 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YHR022C	YHR022C	771 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	IMP3	YHR148W	552 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YJR071W	YJR071W	369 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	NNF1	YJR112W	606 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	ECI1	YLR284C	843 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	YLR365W	YLR365W	333 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	ATG16	YMR159C	453 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	BAG7	YOR134W	1230 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	TFB6	YOR352W	1032 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	ATG29	YPL166W	642 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	AIM4	YBR194W	372 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	LDH1	YBR204C	1128 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	RRP7	YCL031C	894 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	PRP8	YHR165C	7242 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SAK1	YER129W	3429 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	PEX8	YGR077C	1770 nt		2.54	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.53	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	RIT1	YMR283C	1542 nt		2.53	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	HYP2	YEL034W	474 nt		2.53	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	BRP1	YGL007W	378 nt		2.53	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	OTU2	YHL013C	924 nt		2.53	□□□□□ -2
TY3A-G	Q12173	MDM10	YAL010C	1482 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	HOP1	YIL072W	1818 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YMR046C	YMR046C	1323 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	AIM6	YDL237W	1173 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	TCA17	YEL048C	459 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	ANS1	YHR126C	480 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YKL162C	YKL162C	1209 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	CWC24	YLR323C	780 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	RPS1A	YLR441C	768 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	GAB1	YLR459W	1185 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YNL276C	YNL276C	396 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.51	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		2.51	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YDR124W	YDR124W	975 nt		2.51	□□□□□ -2.01
TY3A-G	Q12173	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.51	□□□□□ -2.01

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