Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 TMC1YOR052C 453 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ATP3YBR039W 936 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YAR1YPL239W 603 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YPR096CYPR096C 303 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 MBA1YBR185C 837 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 RIM4YHL024W 2142 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 CHA4YLR098C 1947 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 SDS23YGL056C 1584 nt3.89□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 CWH43YCR017C 2862 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ARO80YDR421W 2853 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ECM22YLR228C 2445 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 UTP11YKL099C 753 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PIR1YKL164C 1026 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PAM18YLR008C 507 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 HHT2YNL031C 411 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 NOP15YNL110C 663 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 SHG1YBR258C 429 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 RPG1YBR079C 2895 nt3.88□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PPQ1YPL179W 1650 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 GAL11YOL051W 3246 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 RPS14AYCR031C 414 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YRB1YDR002W 606 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PMI40YER003C 1290 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 NBL1YHR199C-A 222 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PFD1YJL179W 330 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ISF1YMR081C 1017 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PRP3YDR473C 1410 nt3.87□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ALO1YML086C 1581 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 BRE4YDL231C 3378 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 MSS4YDR208W 2340 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YDL228CYDL228C 642 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 SDH7YDR511W 402 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YOR131CYOR131C 657 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YPR039WYPR039W 336 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YPR059CYPR059C 387 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 LYS9YNR050C 1341 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 RTS1YOR014W 2274 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 AVT7YIL088C 1473 nt3.86□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 STP1YDR463W 1560 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 LST4YKL176C 2487 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 FUS2YMR232W 2034 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PRP11YDL043C 801 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 snR80snR80 171 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 DPB4YDR121W 591 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YGR053CYGR053C 852 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YGR190CYGR190C 366 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PCL5YHR071W 690 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YLR031WYLR031W 561 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 VTI1YMR197C 654 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 RAD14YMR201C 1116 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 LOS1YKL205W 3303 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 DIT2YDR402C 1470 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 TAF6YGL112C 1551 nt3.85□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 PDR12YPL058C 4536 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 STE5YDR103W 2754 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 HOM2YDR158W 1098 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 AST2YER101C 1293 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 FMP10YER182W 735 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 YIL024CYIL024C 570 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 LSM8YJR022W 330 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 ERP4YOR016C 624 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 NOC2YOR206W 2133 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 snR36snR36 182 nt3.84□□□□□ -1.79
PUS9Q12069 GNT1YOR320C 1476 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 VPS45YGL095C 1734 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 APP1YNL094W 1764 nt3.84□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 MON1YGL124C 1935 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 SEC2YNL272C 2280 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 snR59snR59 78 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YDR102CYDR102C 333 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YAL004WYAL004W 648 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 NNF1YJR112W 606 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 HTA2YBL003C 399 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 PKR1YMR123W 369 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 ICY1YMR195W 384 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YOR082CYOR082C 342 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 IDH2YOR136W 1110 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YPR099CYPR099C 357 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 SPE1YKL184W 1401 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 PEP7YDR323C 1548 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 ROK1YGL171W 1695 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 TPO5YKL174C 1857 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 MCD4YKL165C 2760 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 FAS2YPL231W 5664 nt3.83□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 NCS2YNL119W 1482 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 CGR1YGL029W 363 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 RNR4YGR180C 1038 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YJL015CYJL015C 285 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 MRPL38YKL170W 417 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YOR170WYOR170W 306 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 TIM18YOR297C 579 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 AFT2YPL202C 1251 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 TRK1YJL129C 3708 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 AIM21YIR003W 2040 nt3.82□□□□□ -1.8
PUS9Q12069 YCK3YER123W 1575 nt3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms