Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLFN5Q08AF3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLFN5Q08AF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms