Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBL2Q08999 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBL2Q08999 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms