Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4DQ08499 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms