Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LRP1Q07954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms