Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL16A1Q07092 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL16A1Q07092 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms