Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPAQ06546 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms