Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTDSPL2Q05D32 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTDSPL2Q05D32 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms