Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN12Q05209 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms