Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CHRNEQ04844 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms