Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT17Q04695 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms