Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX2Q02962 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms