Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL6Q02878 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms