Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APBA1Q02410 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms