Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTN2Q02246 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN2Q02246 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms