Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPEQ02224 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms