Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 AFI1YOR129C 2682 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 CLN3YAL040C 1743 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YDL026WYDL026W 312 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 RPL27BYDR471W 411 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 RGI2YIL057C 495 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 BOS1YLR078C 735 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YMR320WYMR320W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 KSP1YHR082C 3090 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 CLN2YPL256C 1638 nt2.06□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 NOP14YDL148C 2433 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 TCA17YEL048C 459 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YGR018CYGR018C 330 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YJL169WYJL169W 369 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 ARC19YKL013C 516 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YKL162CYKL162C 1209 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YLL047WYLL047W 384 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 GAB1YLR459W 1185 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 ADI1YMR009W 540 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YOR097CYOR097C 528 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SRL1YOR247W 633 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 MGM1YOR211C 2646 nt2.05□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 PET100YDR079W 336 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 COBQ0105 1158 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 HOS4YIL112W 3252 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 AIM36YMR157C 768 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YNL276CYNL276C 396 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 DGK1YOR311C 873 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 FIG1YBR040W 897 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YPR142CYPR142C 564 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 GRX1YCL035C 333 nt2.04□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 RAV1YJR033C 4074 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 TRM2YKR056W 1920 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 YLR446WYLR446W 1302 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SEM1YDR363W-A 270 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 MPS2YGL075C 1164 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SCH9YHR205W 2475 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 URB2YJR041C 3525 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 TAE2YPL009C 3117 nt2.03□□□□□ -2.08
NUP49Q02199 SIP3YNL257C 3690 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YMR046CYMR046C 1323 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 TFB1YDR311W 1929 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 TIF35YDR429C 825 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 KEG1YFR042W 603 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 UPF3YGR072W 1164 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 MMF1YIL051C 438 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YKL070WYKL070W 510 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 PSY1YKL076C 384 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SPP381YBR152W 876 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 POL4YCR014C 1749 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 BIT61YJL058C 1632 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SLN1YIL147C 3663 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SCP160YJL080C 3669 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 BUB1YGR188C 3066 nt2.02□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 PEX5YDR244W 1839 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 GIS1YDR096W 2685 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SEC16YPL085W 6588 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 RPL13AYDL082W 600 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YDL186WYDL186W 834 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 HLR1YDR528W 1272 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 IMP3YHR148W 552 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 LIP2YLR239C 987 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 END3YNL084C 1050 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 MBA1YBR185C 837 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 DPB3YBR278W 606 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YRR1YOR162C 2433 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SDC25YLL016W 3147 nt2.01□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 RGL1YPL066W 1440 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 UFD4YKL010C 4452 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 FMN1YDR236C 657 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 MIG2YGL209W 1149 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 TWF1YGR080W 999 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 FIP1YJR093C 984 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SRL3YKR091W 741 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 PRM6YML047C 1059 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 RUF20RUF20 443 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 EAF7YNL136W 1278 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 ATG19YOL082W 1248 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YOL166CYOL166C 339 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 MCT1YOR221C 1083 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 ERT1YBR239C 1590 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 BRE1YDL074C 2103 nt2□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 VTC3YPL019C 2508 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 SNU114YKL173W 3027 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 RRI1YDL216C 1323 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 APC11YDL008W 498 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YAP5YIR018W 738 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 PAU8YAL068C 363 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 PAU23YLR037C 375 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 POP8YBL018C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
NUP49Q02199 YMR178WYMR178W 825 nt1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.8 ms