Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC6A3Q01959 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC6A3Q01959 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms