Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2C1P98194 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2C1P98194 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms