Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKD1P98161 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKD1P98161 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PKD1P98161 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PKD1P98161 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PKD1P98161 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PKD1P98161 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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PKD1P98161 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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