Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMAD3P84022 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms