Protein–RNA interactions for Protein: P83110

HTRA3, Serine protease HTRA3, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA3P83110 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA3P83110 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms