Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSNK2A1P68400 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms