Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTA1P68133 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTA1P68133 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms