Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTA2P62736 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTA2P62736 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms