Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PROK1P58294 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PROK1P58294 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PROK1P58294 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms