Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV3P56539 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms