Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP7P55210 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP7P55210 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP7P55210 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP7P55210 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP7P55210 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP7P55210 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP7P55210 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP7P55210 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP7P55210 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms