Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA8P53708 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA8P53708 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA8P53708 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms