Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK4P51957 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK4P51957 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK4P51957 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK4P51957 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK4P51957 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK4P51957 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK4P51957 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms