Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN6P51797 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms