Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCN3P51790 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCN3P51790 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms