Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK1EP49674 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK1EP49674 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms