Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK8P49336 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK8P49336 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK8P49336 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK8P49336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms