Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSSP48449 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSSP48449 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSSP48449 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSSP48449 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSSP48449 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSSP48449 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSSP48449 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSSP48449 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms