Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGIRP43119 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms