Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3CBP42338 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3CBP42338 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms