Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF9P41273 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF9P41273 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms