Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2IP36954 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2IP36954 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms