Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLT4P35916 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLT4P35916 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FLT4P35916 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLT4P35916 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLT4P35916 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLT4P35916 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLT4P35916 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FLT4P35916 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FLT4P35916 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms