Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT9P35527 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT9P35527 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT9P35527 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms